Er zijn veel organisaties actief in de Duitse en Nederlandse waddenregio: Nationale, regionale en lokale overheden, belangenorganisaties en allerlei instellingen. Op de volgende lijst met links staan de organisaties die betrokken waren bij de aanwijzing van de Waddenzee als Werelderfgoed. De lijst omvat niet alle organisaties die in het Waddengebied actief zijn en zal in de loop van tijd worden aangevuld.

Overheid

Nederland:

Ministerie van Economische Zaken, Landbouw en Innovatie

Regiecollege Waddengebied (RCW)

De Waddeneilanden

Waddenzeegemeenten

Provincie Fryslân

Provincie Groningen

Provincie Noord Holland

Duitsland:

Bundesministerium für Umwelt, Naturschutz und Reaktorsicherheit

Bundesamt für Naturschutz

Nationalpark Wattenmeer (Niedersachsen, Schleswig-Holstein, Hamburg)

Niedersächsisches Ministerium für Umwelt, Energie und Klimaschutz

Ministerium für Landwirtschaft, Umwelt und ländliche Räume des Landes Schleswig-Holstein

UNESCO

Bezoekerscentra

Toeristische Regio's